Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF4P48230 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms