Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME1P48163 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME1P48163 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME1P48163 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms