Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms