Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NR4A2P43354 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NR4A2P43354 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NR4A2P43354 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR4A2P43354 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms