Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL3P36405 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms