Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT3P35638 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms