Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFC1P35251 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFC1P35251 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFC1P35251 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFC1P35251 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFC1P35251 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFC1P35251 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFC1P35251 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFC1P35251 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFC1P35251 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms