Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG3P32926 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSG3P32926 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSG3P32926 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG3P32926 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms