Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms