Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKBRP32239 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms