Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA6P31267 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms