Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP1P29466 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP1P29466 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP1P29466 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP1P29466 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP1P29466 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms