Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms