Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B4P23634 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B4P23634 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms