Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRGP23470 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRGP23470 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
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