Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPREP23469 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPREP23469 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPREP23469 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPREP23469 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms