Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGS1P23219 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms