Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1P21675 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1P21675 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1P21675 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1P21675 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1P21675 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1P21675 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1P21675 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1P21675 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1P21675 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1P21675 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1P21675 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1P21675 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1P21675 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1P21675 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1P21675 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1P21675 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1P21675 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1P21675 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1P21675 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms