Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB1P20618 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms