Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms