Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRAP18433 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRAP18433 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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