Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPCAMP16422 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms