Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACADSP16219 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACADSP16219 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACADSP16219 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms