Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOLR1P15328 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOLR1P15328 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms