Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms