Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD28P10747 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD28P10747 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD28P10747 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD28P10747 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD28P10747 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD28P10747 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD28P10747 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD28P10747 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD28P10747 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CD28P10747 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms