Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms