Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC166P0CW27 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms