Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB5P09067 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms