Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HSP90AB1P08238 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms