Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB1P08034 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB1P08034 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJB1P08034 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJB1P08034 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms