Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPBP07199 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPBP07199 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPBP07199 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPBP07199 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPBP07199 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPBP07199 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPBP07199 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms