Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms