Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGR5O75473 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGR5O75473 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGR5O75473 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms