Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms