Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM4AO75164 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM4AO75164 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms