Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GMDSO60547 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GMDSO60547 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms