Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIAA0556O60303 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIAA0556O60303 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms