Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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