Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-9■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-9■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 GOLGA2-202ENST00000450617 1439 ntTSL 511.46□□□□□ -0.574e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 GOLGA2-214ENST00000611957 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.911e-9■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.921e-9■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.525e-7■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)6.12□□□□□ -1.435e-7■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)5.87□□□□□ -1.475e-7■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.475e-7■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.485e-7■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.63e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 DGAT2-206ENST00000604733 885 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 DGAT2-207ENST00000604935 618 ntTSL 49.99□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 DGAT2-203ENST00000603276 747 ntTSL 58.18□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 CDK10-216ENST00000561477 535 ntTSL 311.81□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.714e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.684e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PYCR3-206ENST00000482616 830 ntTSL 216.99■□□□□ 0.314e-11■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-202ENST00000382240 1991 ntTSL 216.98■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 POLR3E-204ENST00000561494 575 ntTSL 316.84■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 POLR3E-207ENST00000563766 2061 ntTSL 216.58■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SPATA20-221ENST00000512181 1456 ntTSL 215.85■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-205ENST00000519665 2128 ntTSL 515.16■□□□□ 0.023e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 POLR3E-214ENST00000565358 565 ntTSL 415.07■□□□□ 04e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 POLR3E-205ENST00000563024 473 ntTSL 415.07■□□□□ 04e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-207ENST00000521458 541 ntTSL 214.84□□□□□ -0.033e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 BMPR1A-205ENST00000638429 5632 ntTSL 514.73□□□□□ -0.054e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-220ENST00000576268 1091 ntTSL 314.5□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-204ENST00000518997 679 ntTSL 314.46□□□□□ -0.093e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-208ENST00000522493 530 ntTSL 414.46□□□□□ -0.093e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-203ENST00000518067 849 ntTSL 514.06□□□□□ -0.163e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 POLR3E-212ENST00000564883 560 ntTSL 413.64□□□□□ -0.234e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.254e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SPATA20-210ENST00000505336 534 ntTSL 413.4□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-209ENST00000523140 840 ntTSL 313.34□□□□□ -0.273e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-214ENST00000574415 1006 ntTSL 513.33□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SPATA20-228ENST00000635113 1706 ntTSL 1 (best)13.02□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-218ENST00000575632 979 ntTSL 212.96□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 512.77□□□□□ -0.374e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TBC1D17-208ENST00000600354 1547 ntTSL 212.68□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TBC1D17-203ENST00000594984 1441 ntTSL 512.31□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PKMYT1-207ENST00000572059 880 ntTSL 512.29□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 MYO9A-216ENST00000567560 4056 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.474e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-214ENST00000480194 455 ntTSL 512.12□□□□□ -0.474e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.554e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-211ENST00000524217 400 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-216ENST00000486421 505 ntTSL 511.43□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PHACTR4-209ENST00000633371 597 ntTSL 311.43□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.63e-13■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.64e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PHACTR4-203ENST00000463428 1421 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PHACTR4-205ENST00000632202 918 ntTSL 511.07□□□□□ -0.644e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.654e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SPATA20-220ENST00000511937 2669 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.674e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PECR-202ENST00000442122 1100 ntTSL 210.78□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SPATA20-204ENST00000503063 3232 ntTSL 210.73□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TBC1D17-205ENST00000596243 2831 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.724e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SPATA20-222ENST00000512416 845 ntTSL 310.35□□□□□ -0.754e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SNRNP27-203ENST00000450162 766 ntTSL 210.29□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PYCR3-205ENST00000462036 579 ntTSL 410.26□□□□□ -0.774e-11■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 POLR3E-216ENST00000567022 584 ntTSL 210.23□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PHACTR4-206ENST00000632421 3375 ntTSL 210.11□□□□□ -0.794e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 TMEM14B-218ENST00000491103 871 ntTSL 59.87□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 POLR3E-210ENST00000564256 449 ntTSL 39.42□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 PHACTR4-204ENST00000493669 3078 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.094e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.06□□□□□ -1.124e-6■■■■□ 21.2
RBFOX2O43251 SF3B2-216ENST00000534765 3932 ntTSL 27.65□□□□□ -1.184e-6■■■■□ 21.2
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