Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACOX3O15254 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms