Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIT3O14879 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIT3O14879 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms