Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms