Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms