Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
J3KT08 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
J3KT08 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms