Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms