Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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