Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB9F8W1W9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB9F8W1W9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms