Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms