Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E9PBE3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E9PBE3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E9PBE3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E9PBE3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
E9PBE3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E9PBE3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E9PBE3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms